Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF2Q12947 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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