Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PTPRJQ12913 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PTPRJQ12913 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PTPRJQ12913 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PTPRJQ12913 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PTPRJQ12913 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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PTPRJQ12913 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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PTPRJQ12913 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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