Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GRIN2AQ12879 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2AQ12879 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
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