Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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