Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms