Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms