Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF11Q05519 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms