Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms