Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms