Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms