Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POU5F1Q01860 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms