Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms