Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms