Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms