Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms