Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNB1P98172 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms