Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP2P81877 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms