Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRX1P78414 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRX1P78414 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRX1P78414 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRX1P78414 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRX1P78414 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRX1P78414 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRX1P78414 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRX1P78414 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRX1P78414 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRX1P78414 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRX1P78414 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRX1P78414 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms