Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms