Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms