Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME5P56597 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME5P56597 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms