Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA2D1P54289 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D1P54289 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms