Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT4P50991 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT4P50991 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT4P50991 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms