Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms