Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD2P49005 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD2P49005 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD2P49005 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD2P49005 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD2P49005 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD2P49005 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD2P49005 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD2P49005 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD2P49005 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD2P49005 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD2P49005 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD2P49005 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD2P49005 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD2P49005 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD2P49005 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD2P49005 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD2P49005 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD2P49005 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD2P49005 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD2P49005 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD2P49005 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD2P49005 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD2P49005 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD2P49005 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD2P49005 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD2P49005 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD2P49005 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD2P49005 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD2P49005 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD2P49005 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD2P49005 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD2P49005 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLD2P49005 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms