Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM6P40199 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms