Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms