Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THBS4P35443 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THBS4P35443 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THBS4P35443 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THBS4P35443 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THBS4P35443 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THBS4P35443 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THBS4P35443 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THBS4P35443 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THBS4P35443 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THBS4P35443 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THBS4P35443 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THBS4P35443 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THBS4P35443 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THBS4P35443 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THBS4P35443 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THBS4P35443 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THBS4P35443 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THBS4P35443 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THBS4P35443 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THBS4P35443 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THBS4P35443 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THBS4P35443 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THBS4P35443 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THBS4P35443 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THBS4P35443 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THBS4P35443 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THBS4P35443 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THBS4P35443 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THBS4P35443 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THBS4P35443 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms