Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA4P35212 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA4P35212 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA4P35212 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA4P35212 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA4P35212 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA4P35212 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA4P35212 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA4P35212 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA4P35212 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA4P35212 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA4P35212 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms