Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms