Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms