Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms