Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMPK1P30085 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms