Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms