Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP1P28562 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms