Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms