Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms