Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO1P25800 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMO1P25800 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMO1P25800 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMO1P25800 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMO1P25800 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMO1P25800 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMO1P25800 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMO1P25800 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO1P25800 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO1P25800 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms