Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO2P25791 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO2P25791 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms