Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms