Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRDP23468 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms