Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTGS1P23219 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTGS1P23219 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms