Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMPD1P23109 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms