Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHCGRP22888 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHCGRP22888 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHCGRP22888 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHCGRP22888 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHCGRP22888 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHCGRP22888 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LHCGRP22888 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHCGRP22888 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHCGRP22888 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHCGRP22888 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHCGRP22888 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHCGRP22888 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms