Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FGFR3P22607 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms