Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD247P20963 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD247P20963 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD247P20963 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms