Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms