Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms