Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSP16219 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSP16219 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSP16219 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSP16219 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSP16219 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSP16219 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSP16219 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSP16219 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSP16219 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSP16219 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSP16219 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSP16219 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSP16219 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms