Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGA4P13612 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGA4P13612 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGA4P13612 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGA4P13612 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGA4P13612 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGA4P13612 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGA4P13612 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGA4P13612 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGA4P13612 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGA4P13612 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA4P13612 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA4P13612 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA4P13612 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA4P13612 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA4P13612 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGA4P13612 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms